2006（H18）年度
| 遺跡名 | 所在地 | 時代 | 発掘調査期間（予定） | 事業 |
| 興屋川原（3次） （こうやがわら） |
鶴岡市 | 古墳～平安 | 5/8～9/22 | 日本海沿岸東北自動車道 |
| 行司免（3次） （ぎょうじめん） |
鶴岡市 | 平安 | 4/17～8/11 | 日本海沿岸東北自動車道 |
| 矢馳A（3次） （やばせ） |
鶴岡市 | 古墳～平安 | 4/17～11/8 | 日本海沿岸東北自動車道 |
| 木の下館跡（3次） （きのしたたてあと） |
鶴岡市 | 中世 | 4/17～7/26 | 日本海沿岸東北自動車道 |
| 玉作1（2次） （たまつくり） |
鶴岡市 | 古墳 | 7/31～10/13 | 日本海沿岸東北自動車道 |
| 岩崎 （いわさき） |
鶴岡市 | 古墳～中世 | 4/25～11/8 | 日本海沿岸東北自動車道 |
| 南田 （みなみだ） |
鶴岡市 | 奈良・平安 | 8/21～11/29 | 日本海沿岸東北自動車道 |
| 中川原C （なかがわら） |
新庄市 | 奈良・平安 | 5/10～7/6 | ふるさと農道緊急整備 |
| 中山城跡（2次） （なかやまじょうあと） |
上山市 | 縄文・中世・近世 | 4/24～10/31 | 国道13号線上山バイパス |
| 加藤屋敷 （かとうやしき） |
南陽市 | 奈良・平安 | 5/17～11/2 | 国道13号線上山バイパス |
| 石畑 （いしばたけ） |
南陽市 | 縄文 | 5/15～8/10 | 主要地方道山形南陽線 |
| 檜原（1次） （ひのきばら） |
南陽市 | 奈良・平安 | 8/21～9/22 | 主要地方道米沢白鷹線 |
| 檜原（2次） （ひのきばら） |
南陽市 | 奈良・平安 | 5/9～9/22 | 国道113号赤湯バイパス |
| 上大作裏 （かみおおざくうら） |
南陽市 | 奈良・平安 | 5/8～7/25 | 国道113号赤湯バイパス |
| 天王 （てんのう） |
南陽市 | 奈良・平安 | 5/10～12/5 | 国道113号赤湯バイパス |
| 上野（2次） （わの） |
南陽市 | 縄文～近世 | 5/8～6/30 9/4～9/22 |
農地環境整備 |
| 稲荷山館跡 （いなりやまたてあと） |
米沢市 | 中世 | 7/17～8/4 | 東北中央自動車道（福島県境～米沢間） |
| 山ノ下 （やまのした） |
米沢市 | 縄文 | 5/9～7/14 | 東北中央自動車道（福島県境～米沢間） |
| 下叶水 （しもかのうみず） |
小国町 | 縄文・中世・近世 | 5/8～11/2 | 横川ダム建設 |